Кокилдорота- это необычное со своему строение купольное здание. Архитектуру портала здания, по словам некоторых исследователей, можно отнести к временам Темуридов. Внутренняя часть здания включает в себя надгробные плиты, одна из которых принадлежит святому Кокилдор-Ота.